CellForge是一个基于多智能体框架的代理系统，旨在将生物数据集和研究目标直接转化为优化的虚拟细胞计算模型。该系统通过三个核心模块（任务分析、方法设计和实验执行）实现自动化建模，能够处理单细胞多组学数据并生成优化的模型架构和可执行代码。在六个涵盖基因敲除、药物处理和细胞因子刺激等不同模态的数据集上，CellForge在单细胞扰动预测任务中表现优于现有最先进方法。